Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms