Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N3

CLCA3P, Calcium-activated chloride channel regulator family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA3PQ9Y6N3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA3PQ9Y6N3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA3PQ9Y6N3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA3PQ9Y6N3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA3PQ9Y6N3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA3PQ9Y6N3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCA3PQ9Y6N3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCA3PQ9Y6N3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCA3PQ9Y6N3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCA3PQ9Y6N3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCA3PQ9Y6N3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA3PQ9Y6N3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLCA3PQ9Y6N3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCA3PQ9Y6N3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms