Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6E7

SIRT4, NAD-dependent protein lipoamidase sirtuin-4, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT4Q9Y6E7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRT4Q9Y6E7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRT4Q9Y6E7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT4Q9Y6E7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT4Q9Y6E7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT4Q9Y6E7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT4Q9Y6E7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT4Q9Y6E7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT4Q9Y6E7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT4Q9Y6E7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT4Q9Y6E7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRT4Q9Y6E7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms