Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN16Q9Y5I7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN16Q9Y5I7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms