Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGA8Q9Y5G5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHGA8Q9Y5G5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms