Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Q9Y3F1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Q9Y3F1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Q9Y3F1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q9Y3F1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms