Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
L1RE1Q9UN81 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
L1RE1Q9UN81 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
L1RE1Q9UN81 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms