Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PADI4Q9UM07 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PADI4Q9UM07 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PADI4Q9UM07 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms