Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP17Q9ULZ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MMP17Q9ULZ9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP17Q9ULZ9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP17Q9ULZ9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms