Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CFDP1Q9UEE9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CFDP1Q9UEE9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
CFDP1Q9UEE9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CFDP1Q9UEE9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CFDP1Q9UEE9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CFDP1Q9UEE9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CFDP1Q9UEE9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CFDP1Q9UEE9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CFDP1Q9UEE9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CFDP1Q9UEE9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CFDP1Q9UEE9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CFDP1Q9UEE9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CFDP1Q9UEE9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CFDP1Q9UEE9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CFDP1Q9UEE9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CFDP1Q9UEE9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CFDP1Q9UEE9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CFDP1Q9UEE9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CFDP1Q9UEE9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CFDP1Q9UEE9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CFDP1Q9UEE9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CFDP1Q9UEE9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CFDP1Q9UEE9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CFDP1Q9UEE9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CFDP1Q9UEE9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
CFDP1Q9UEE9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
CFDP1Q9UEE9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CFDP1Q9UEE9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CFDP1Q9UEE9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CFDP1Q9UEE9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CFDP1Q9UEE9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CFDP1Q9UEE9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CFDP1Q9UEE9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CFDP1Q9UEE9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFDP1Q9UEE9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms