Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEF1Q9UBV8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEF1Q9UBV8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEF1Q9UBV8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEF1Q9UBV8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PEF1Q9UBV8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEF1Q9UBV8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEF1Q9UBV8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEF1Q9UBV8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEF1Q9UBV8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEF1Q9UBV8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEF1Q9UBV8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEF1Q9UBV8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEF1Q9UBV8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEF1Q9UBV8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEF1Q9UBV8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEF1Q9UBV8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PEF1Q9UBV8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEF1Q9UBV8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEF1Q9UBV8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEF1Q9UBV8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms