Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
MYO1AQ9UBC5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYO1AQ9UBC5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MYO1AQ9UBC5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms