Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMOD2Q9NZR1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMOD2Q9NZR1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD2Q9NZR1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMOD2Q9NZR1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMOD2Q9NZR1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMOD2Q9NZR1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
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