Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYOFQ9NZM1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MYOFQ9NZM1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYOFQ9NZM1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYOFQ9NZM1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms