Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms