Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF38Q9NXL2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF38Q9NXL2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF38Q9NXL2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF38Q9NXL2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF38Q9NXL2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF38Q9NXL2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF38Q9NXL2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGEF38Q9NXL2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARHGEF38Q9NXL2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF38Q9NXL2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF38Q9NXL2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms