Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK13-1Q9NX77 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK13-1Q9NX77 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms