Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZDHHC18Q9NUE0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZDHHC18Q9NUE0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZDHHC18Q9NUE0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZDHHC18Q9NUE0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms