Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRMQ9NS64 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPRMQ9NS64 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms