Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX5

NPDC1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPDC1Q9NQX5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPDC1Q9NQX5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPDC1Q9NQX5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPDC1Q9NQX5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms