Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPRD1BQ9NQG5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPRD1BQ9NQG5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPRD1BQ9NQG5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPRD1BQ9NQG5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1991.9 ms