Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD7Q9NPI1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD7Q9NPI1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms