Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST11Q9NPF2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST11Q9NPF2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST11Q9NPF2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms