Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRM3Q9NNZ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRM3Q9NNZ6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRM3Q9NNZ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms