Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R2

MUC13, Mucin-13, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC13Q9H3R2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MUC13Q9H3R2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC13Q9H3R2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MUC13Q9H3R2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
MUC13Q9H3R2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MUC13Q9H3R2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MUC13Q9H3R2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MUC13Q9H3R2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MUC13Q9H3R2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms