Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASSF4Q9H2L5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASSF4Q9H2L5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASSF4Q9H2L5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASSF4Q9H2L5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASSF4Q9H2L5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASSF4Q9H2L5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASSF4Q9H2L5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RASSF4Q9H2L5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms