Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
KDM5DQ9BY66 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
KDM5DQ9BY66 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
KDM5DQ9BY66 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
KDM5DQ9BY66 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KDM5DQ9BY66 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KDM5DQ9BY66 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
KDM5DQ9BY66 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KDM5DQ9BY66 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
KDM5DQ9BY66 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
KDM5DQ9BY66 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
KDM5DQ9BY66 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
KDM5DQ9BY66 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
KDM5DQ9BY66 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
KDM5DQ9BY66 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
KDM5DQ9BY66 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
KDM5DQ9BY66 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KDM5DQ9BY66 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
KDM5DQ9BY66 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
KDM5DQ9BY66 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
KDM5DQ9BY66 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
KDM5DQ9BY66 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
KDM5DQ9BY66 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
KDM5DQ9BY66 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
KDM5DQ9BY66 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
KDM5DQ9BY66 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5DQ9BY66 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5DQ9BY66 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
KDM5DQ9BY66 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
KDM5DQ9BY66 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
KDM5DQ9BY66 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
KDM5DQ9BY66 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
KDM5DQ9BY66 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
KDM5DQ9BY66 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms