Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
SALL3Q9BXA9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SALL3Q9BXA9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SALL3Q9BXA9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms