Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX74

TM2D1, TM2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1Q9BX74 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM2D1Q9BX74 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TM2D1Q9BX74 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms