Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCRT1Q9BWW7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCRT1Q9BWW7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCRT1Q9BWW7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCRT1Q9BWW7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCRT1Q9BWW7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCRT1Q9BWW7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SCRT1Q9BWW7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms