Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MKNK1Q9BUB5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKNK1Q9BUB5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MKNK1Q9BUB5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MKNK1Q9BUB5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MKNK1Q9BUB5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKNK1Q9BUB5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKNK1Q9BUB5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKNK1Q9BUB5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MKNK1Q9BUB5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKNK1Q9BUB5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKNK1Q9BUB5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKNK1Q9BUB5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKNK1Q9BUB5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKNK1Q9BUB5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKNK1Q9BUB5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKNK1Q9BUB5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKNK1Q9BUB5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms