Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RSG1Q9BU20 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSG1Q9BU20 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSG1Q9BU20 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms