Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PI4K2AQ9BTU6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PI4K2AQ9BTU6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PI4K2AQ9BTU6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PI4K2AQ9BTU6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PI4K2AQ9BTU6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PI4K2AQ9BTU6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PI4K2AQ9BTU6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PI4K2AQ9BTU6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PI4K2AQ9BTU6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PI4K2AQ9BTU6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PI4K2AQ9BTU6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PI4K2AQ9BTU6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PI4K2AQ9BTU6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PI4K2AQ9BTU6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms