Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PAGR1Q9BTK6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PAGR1Q9BTK6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PAGR1Q9BTK6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PAGR1Q9BTK6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PAGR1Q9BTK6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PAGR1Q9BTK6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PAGR1Q9BTK6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PAGR1Q9BTK6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PAGR1Q9BTK6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PAGR1Q9BTK6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PAGR1Q9BTK6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PAGR1Q9BTK6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PAGR1Q9BTK6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PAGR1Q9BTK6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PAGR1Q9BTK6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PAGR1Q9BTK6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PAGR1Q9BTK6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PAGR1Q9BTK6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PAGR1Q9BTK6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms