Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C2orf88Q9BSF0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf88Q9BSF0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms