Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA1CQ9BQE3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA1CQ9BQE3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms