Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLX1AQ9BQ83 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLX1AQ9BQ83 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLX1AQ9BQ83 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms