Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCC1Q96RQ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCCC1Q96RQ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCCC1Q96RQ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms