Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PKNOX2Q96KN3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKNOX2Q96KN3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKNOX2Q96KN3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKNOX2Q96KN3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms