Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLPTM1LQ96KA5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLPTM1LQ96KA5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms