Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM12Q96EX1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM12Q96EX1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.2 ms