Protein–RNA interactions for Protein: Q92930

RAB8B, Ras-related protein Rab-8B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8BQ92930 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB8BQ92930 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB8BQ92930 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB8BQ92930 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB8BQ92930 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB8BQ92930 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB8BQ92930 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB8BQ92930 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB8BQ92930 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB8BQ92930 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB8BQ92930 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB8BQ92930 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB8BQ92930 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB8BQ92930 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB8BQ92930 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB8BQ92930 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB8BQ92930 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB8BQ92930 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB8BQ92930 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB8BQ92930 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.6 ms