Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBXN4Q92575 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBXN4Q92575 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN4Q92575 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms