Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATRIPQ8WXE1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATRIPQ8WXE1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATRIPQ8WXE1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATRIPQ8WXE1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATRIPQ8WXE1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms