Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM58Q8NG06 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM58Q8NG06 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRIM58Q8NG06 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM58Q8NG06 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms