Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP9

NBEA, Neurobeachin, humanhuman

Predictions only

Length 2,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAQ8NFP9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBEAQ8NFP9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBEAQ8NFP9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBEAQ8NFP9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms