Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD1Q8NB12 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD1Q8NB12 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMYD1Q8NB12 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms