Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCD7Q8N8D1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDCD7Q8N8D1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms