Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC17Q8N6Y2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC17Q8N6Y2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC17Q8N6Y2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms