Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SVOPQ8N4V2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SVOPQ8N4V2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SVOPQ8N4V2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms